W części osadowo-biogazowej odbywa się przetwarzanie osadu ściekowego. Osad wstępny podlega wstępnej, kwaśnej fermentacji w grawitacyjnych zagęszczaczo-fermenterach. Właściwy dobór hydraulicznego czasu zatrzymania i niskie obciążenie powierzchniowe (< 50 kgSm/m² x d) prowadzić ma do generowania lotnych kwasów tłuszczowych (LKT). Bogata w LKT ciecz nadosadowa kierowana jest do komór biologicznych jako substrat wspomagający usuwanie związków biogennych (fosforu i azotu). Osad wstępny z zagęszczaczo-fermentera i osad nadmierny po zagęszczeniu mechanicznym trafiają do komór fermentacyjnych, gdzie w temperaturze 37°C, przez okres około 25 dni, podlegają fermentacji metanowej mezofilowej.

Przefermentowany osad jest odwadniany na prasach taśmowych i dalej trafia do suszarni osadu, gdzie jest suszony do > 90% suchej masy, lub – z pominięciem suszenia – trafia do specjalnych kontenerów. Zarówno w postaci wysuszonej, jak i niewysuszonej, opuszcza teren oczyszczalni.

Biogaz z komór fermentacyjnych ujmowany jest i odprowadzany do stacji odsiarczania katalitycznego celem usunięcia siarkowodoru, zgodnie z wymaganiami ochrony urządzeń, które są jego odbiornikami (gazogeneratory i kotły). Zastosowana metoda Biosulfeks typu mokrego polega na rozkładzie siarkowodoru do elementarnej siarki w obecności katalizatora. Cecha charakterystyczna tej metody to brak ścieków, co jest możliwe dzięki zastosowaniu cyrkulacji roztworu pochodzącego z przepłukiwania biogazu.