Przedsięwzięcie, podobnie jak obecnie wdrażany Projekt Ochrony Przeciwpowodziowej Dorzecza Odry, będzie realizowane z pomocą międzynarodowych instytucji finansowych: Międzynarodowego Banku Odbudowy i Rozwoju (Banku Światowego) oraz Banku Rozwoju Rady Europy. Środki na realizację inwestycji będą pochodzić także z Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowiska, budżetu państwa i Narodowego Funduszu Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej.

Celem POPDOW jest poprawa bezpieczeństwa przeciwpowodziowego osób mieszkających na obszarze dorzecza Odry i dorzecza górnej Wisły. Ma to zostać osiągnięte poprzez szereg inwestycji w infrastrukturę hydrotechniczną, obejmujących: rozbudowę i przebudowę wałów, umocnienie i stabilizację brzegów, budowę obiektów poprawiających możliwość przeprowadzania fali wezbraniowych przez tereny zurbanizowane, budowę zbiorników i innych obiektów poprawiających możliwości retencyjne.

POPDOW przewiduje także powstanie infrastruktury zarządzania powodziowego wraz z powiązanymi z nią środkami technicznymi na trzech obszarach Polski: dorzecza środkowej i dolnej Odry, Kotliny Kłodzkiej (dorzecze Nysy Kłodzkiej) oraz dorzecza górnej Wisły. Dzięki tym inwestycjom znacząco wzmocniony zostanie krajowy system prognozowania powodzi i zdolności operacyjne służb, szczególnie w Polsce południowej i zachodniej.